L'intervento di “Interramento della stazione di Catania Centrale e realizzazione del raddoppio su nuovo tracciato tra Catania Centrale e Catania Acquicella” si estende da nord-est a sud-ovest della città di Catania. La linea ferroviaria di progetto parte dalla fermata Catania Europa, attraversa poi la stazione di Catania Centrale, il porto di Catania e procede verso Siracusa fino a poco più a sud della stazione di Fontanarossa.

Il tracciato ha uno sviluppo di circa 7 km ed è prossimo alla costa, con quote che in alcuni tratti sono sotto il livello dello zero medio mare. 

L'area è caratterizzata dalla presenza di due corsi d'acqua:

•             il fiume sotterraneo Amenano che si trova all'incirca all'altezza del km 2+625

•             il torrente Acquicella che interseca la tratta ferroviaria circa all'altezza del km 4+700.

Sono previsti tratti all'aperto (rilevato o trincea), nonché tratti in galleria artificiale e in galleria naturale.